慢性扁桃体炎尚无必定有效的保守疗法，但中药、扁桃体部分用药、冷冻、理疗等皆有人试用。也可进行扁桃体切除术。曩昔，为防止扁桃体病灶引起严重并发病，扁桃体切除术甚为普遍。近年因为认识到扁桃体具有免疫功用，对切除扁桃体是否有益发生争议。故手术已较前有所减少。对手术适应症、手术效果及切除扁桃体是否会影响机体免疫功用等也存在不同见地。据近年研究，扁桃体参与体液免疫和细胞免疫，能够发生组成各种免疫球蛋白的B淋巴细胞。

因此有人认为切除扁桃体能够影响部分免疫功用，但对全身免疫功用无影响。以下状况能够行扁桃体切除术：

1、保定哪里能看扁桃体炎重复急性发生或有扁桃体周围脓肿史者；

2、或许是引起其他部位病变的原发病灶；

3、影响正常呼吸或吞咽功用。为防止对免疫功用有不良影响，一般在6岁以前不可扁桃休切除术。影响吞咽及呼吸者，能够切除一侧扁桃体，以解除功用障碍。有出血倾向，继发病活动期手术或许造成继发病恶化以及患者健康条件不允许时，则不应手术。